2024-05-20 08:58:17
近日，筆者從云南省科技廳了解到，云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)云上黑山羊基因身份證和云上黑山羊50K育種芯片。
云上黑山羊基因身份證和50K育種芯片作為云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院自主研發(fā)、具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的檢測(cè)手段，不但可以開展國家級(jí)主導(dǎo)品種——云上黑山羊的精準(zhǔn)鑒定，而且能夠提高云上黑山羊精準(zhǔn)育種水平和育種效率，為規(guī)范云上黑山羊種羊推廣、提高云上黑山羊種質(zhì)價(jià)值提供了技術(shù)支撐。
云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)對(duì)我國南方主要的4個(gè)黑山羊品種（類群）160只個(gè)體進(jìn)行深度基因組測(cè)序獲取各品種特異性位點(diǎn)后，利用Mass Array分子檢測(cè)平臺(tái)對(duì)3072個(gè)樣本進(jìn)行分型檢測(cè)，借助機(jī)器學(xué)習(xí)方法建立了云上黑山羊鑒定模型并完成模型的優(yōu)化，挖掘出能夠作為純種云上黑山羊基因標(biāo)識(shí)鑒定的26個(gè)SNP位點(diǎn)，最終研發(fā)出云上黑山羊基因身份證，目前該基因身份證鑒定成功率達(dá)90%，是國內(nèi)唯一開展云上黑山羊品種鑒定的試劑盒。
云上黑山羊50K育種芯片，基于山羊通用芯片功能位點(diǎn)，融合了74個(gè)云上黑山羊繁殖性狀、生長(zhǎng)性狀和基因身份證的功能位點(diǎn)共計(jì)5萬個(gè)SNP位點(diǎn)，平均檢出率可達(dá)98.77%，分型一致性可達(dá)99.3%，比通用芯片檢測(cè)成本降低30.91%。該芯片不但可用于云上黑山羊全基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因挖掘，還可用于云南本地山羊種質(zhì)資源創(chuàng)新利用與保護(hù)、親緣關(guān)系鑒定等，是目前國內(nèi)唯一一款云上黑山羊育種芯片，相較通用芯片，在降低分子育種成本、提高選種準(zhǔn)確率方面優(yōu)勢(shì)明顯。
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