2020-08-05 10:56:25
記者日前從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所獲悉，該所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼，構(gòu)建了油菜10萬余個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄全景圖，使得油菜功能基因研究第一次有了相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫，為相關(guān)研究提供了有力支撐。該項(xiàng)研究成果日前在線發(fā)表在國(guó)際知名期刊《The Plant Journal》上。
據(jù)參與該項(xiàng)研究的相關(guān)科研人員介紹，油菜基因組包含約12億個(gè)堿基和10萬余個(gè)基因，如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務(wù)。根據(jù)分子生物學(xué)的中心法則，基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA(信使核糖核酸)再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式，一個(gè)基因可以形成許多種不同的mRNA。此前，由于技術(shù)和資源的限制，油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫，導(dǎo)致油菜功能基因研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。
為了突破這一瓶頸，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)采用最新的三代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確測(cè)定了油菜全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組，并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法，成功繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖，構(gòu)建了油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫。該研究成果更新了人們對(duì)油菜基因和基因組的認(rèn)識(shí)和理解，將為甘藍(lán)型油菜功能基因和遺傳改良研究，及基因組設(shè)計(jì)育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。作者：侯文坤
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